三天两晚南京秦淮夫子庙美食攻略如下：
第一天：夫子庙及周边美食体验
上午：
- 夫子庙景区内品尝小吃：夫子庙周边有许多传统小吃，如秦淮八绝（盐水鸭、鸭血粉丝汤、小笼包、鸭油酥饼、牛肉锅贴、糖粥、豆腐涝、鸡鸣汤包）。可以尝试品尝这些特色美食，感受南京的市井文化。
中午：
- 南京大排档：位于夫子庙附近的南京大排档，是品尝南京特色菜肴的好去处。推荐尝试鸭血粉丝汤、小笼包、盐水鸭等。
下午：
- 夫子庙步行街：在夫子庙步行街继续品尝各种小吃，如糖粥、豆腐涝等。
- 老门东历史文化街区：逛逛老门东，这里有很多特色小吃店和咖啡馆，可以边走边吃，感受古都风情。
晚上：
- 秦淮小吃：在夫子庙附近的秦淮小吃街，可以品尝到更多南京特色小吃，如鸭油酥饼、牛肉锅贴等。
- 夫子庙夜游：晚上可以选择乘坐画舫在秦淮河上夜游，欣赏两岸古建筑和夜景，同时品尝船上提供的美食。
第二天：南京美食深度游
上午：
- 南京博物院附近美食：在南京博物院附近，有许多特色餐馆，可以品尝到南京的地方特色菜肴，如盐水鸭、鸡鸣汤包等。
中午：
- 老门东特色餐馆：选择一家老门东的特色餐馆，品尝南京传统菜肴，如金陵盐水鸭、鸭血粉丝汤等。
下午：
- 1912街区：逛逛1912街区，这里汇集了各种风格迥异的餐厅和咖啡馆，可以尝试各种美食，如创意料理、西餐、甜品等。
晚上：
- 南京特色餐厅：选择一家南京特色餐厅，享受一顿丰盛的晚餐，如品尝正宗的南京烤鸭、鸡鸣汤包等。
第三天：南京周边美食探索
上午：
- 南京博物院周边：在南京博物院周边，可以找到一些具有地方特色的早餐店，如鸭血粉丝汤、小笼包等。
中午：
- 南京美食街：前往南京的美食街，如新街口、湖南路等，这里汇集了各种美食，可以尝试不同的地方小吃。
下午：
- 玄武湖周边：在玄武湖周边，可以找到一些特色餐厅，品尝湖鲜美食。
晚上：
- 夜宵体验：南京的夜宵文化丰富，可以选择一家夜宵摊，品尝南京的特色烧烤、麻辣烫等。
在享受美食的同时，别忘了南京的文化景点，如夫子庙、秦淮河、南京博物院等，这些地方都是了解南京历史和文化的绝佳去处。祝您在南京的三天两晚美食之旅愉快！