选择性价比高的旅行社进行上海直飞九寨沟旅游，您可以从以下几个方面进行考虑：
价格比较：在决定旅行社之前，先在多个平台和旅行社之间比较价格。根据提供的参考信息，九寨沟三日游的价格一般在1000至3000元人民币之间，具体费用取决于旅游公司、出行时间、团队规模等因素。注意避免那些价格异常低廉的旅行社，因为它们可能存在服务质量不高或隐藏费用等问题。
行程安排：查看旅行社提供的行程安排是否合理，是否包含了往返车费、住宿费、导游服务费、景区门票等。例如，有些旅行社会提供纯玩团，这样的团费通常较高，但服务更全面。
服务质量：了解旅行社的服务质量，包括导游的服务态度、住宿的舒适度、餐食的满意度等。选择那些口碑较好、用户评价高的旅行社。
旅游路线：选择适合自己喜好的路线。比如，如果喜欢深度游，可以选择包含更多景点和活动的旅游团；如果追求舒适和便利，可以选择跟团游。
旅游保险：考虑是否包含旅游保险，以确保旅行安全。好的旅行社通常会为游客购买旅游意外保险。
额外费用：询问是否有额外的自费项目，如观光购物、特色餐厅用餐等，并评估这些项目的必要性。
用户评价：查看其他游客的评价和反馈，了解旅行社的服务质量和行程安排的真实情况。
正规合法：确保旅行社正规合法，有相关的营业执照和旅游业务许可证，以保证旅游质量和安全。
以下是一些具体的建议：
- 参考信息：可以参考四川青年旅行社和成都中国旅行社等正规旅行社的攻略和报价。
- 预订平台：可以在携程、去哪儿、途牛等在线旅游平台查看旅行社的报价和服务内容。
- 直接咨询：直接联系旅行社，询问详细的行程安排、费用包含以及额外费用等。
总之，选择性价比高的旅行社需要综合考虑价格、服务质量、行程安排和用户评价等因素。希望这些建议能帮助您做出明智的选择。