在九寨沟生态旅游可持续发展的SWOT分析中，威胁因素主要包括以下几点：
自然灾害风险：九寨沟地处地震带，历史上发生过多次地震，如2008年的“5·12”汶川大地震和2017年的“8·8”九寨沟7.0级地震，对景区造成了严重破坏。自然灾害的频发给景区的恢复和重建带来压力。
生态环境脆弱性：九寨沟位于高原，生态环境极其脆弱。人类活动、气候变化等因素可能引发水源减少、生物多样性下降等问题，威胁到景区的自然景观和生态平衡。
气候变化：全球气候变化可能导致九寨沟地区降水量减少、温度上升，影响景区的水体、植被和生物多样性。同时，极端气候事件如干旱、洪水等也可能给景区带来威胁。
旅游承载压力：随着旅游业的快速发展，九寨沟的游客数量逐年增加，给景区的生态环境、基础设施和服务能力带来巨大压力。超负荷的旅游承载可能导致资源枯竭、服务质量下降。
法律法规和政策调整：国家对自然保护区的管理和法律法规可能发生变化，如限制开发、提高保护等级等，对九寨沟旅游业的发展带来不确定性。
疫情影响：新冠疫情的全球蔓延对旅游业造成严重冲击，九寨沟作为热门旅游目的地，也受到不同程度的影响，包括游客数量下降、旅游收入减少等。
国际关系和地缘政治风险：国际关系紧张或地缘政治风险可能导致九寨沟的旅游业受到波及，如外国游客减少、国际旅游政策调整等。
竞争加剧：随着周边地区旅游资源的开发和旅游市场的拓展，九寨沟面临来自其他景区的竞争压力，需要不断创新和提升自身竞争力。
综上所述，九寨沟生态旅游可持续发展面临的威胁因素主要包括自然灾害、生态环境脆弱性、气候变化、旅游承载压力、法律法规政策调整、疫情、国际关系和地缘政治风险以及竞争加剧等。