九寨沟作为世界自然遗产地，以其独特的自然景观而闻名，但除了世人皆知的九寨沟景区外，还有一些鲜为人知的小众秘境，这里隐藏着许多自然奇观，以下是一些值得一探的自然奇观：
中查沟：位于九寨沟县漳扎镇，被誉为“九寨沟的后花园”。这里地势险峻，气候多样，拥有丰富的生物多样性和独特的地质景观，如清澈的河流、瀑布和湖泊。
牟尼沟：牟尼沟以其兼具黄龙的钙化彩池和九寨沟的森林湖泊而闻名，拥有巨型的瀑布，景区内游客较少，可以独享这片净土。其中，二道海和扎嘎瀑布是两个主要景点。
箭竹海：位于熊猫海上方，是一个相对隐蔽的景点，周围有许多竹林，是观赏野生动物的好地方。
火花海：位于九寨沟东部，湖水中含有大量矿物质，阳光下会闪烁如火花般的光芒，是体验九寨沟宁静之美的绝佳地点。
树正群海：由多个小湖泊组成，四周被郁郁葱葱的树木环绕，水色清澈，游客相对较少，可以悠闲地欣赏自然美景。
熊猫海：因偶尔有熊猫在此出没而得名，周围有许多竹林，是观赏野生动物的好地方。
长海：九寨沟更大的湖泊之一，湖水清澈见底，周围被高山环绕，景色壮丽。
五花海：以其湖底钙化物的颜色而得名，湖面呈现出红、黄、蓝等多种颜色，如同一块巨大的调色板。
诺日朗瀑布：九寨沟更具代表性的瀑布之一，瀑布宽达300余米，气势磅礴。
这些小众秘境不仅提供了与九寨沟景区不同的自然风光，同时也保留了更多的原始生态和文化韵味，是自然爱好者和探险者不可错过的地方。