上海东方明珠塔附近的海洋水族馆在海洋生物保护方面开展了以下工作：
科普教育：水族馆通过举办各种科普活动，如迪迪课堂、校园科普活动等，向公众普及海洋生物知识，提高公众对海洋生物多样性的认识和重视。
物种保护：水族馆内展示的生物大多数为国家保护动物，如中华鲟、胭脂鱼等，这些展示有助于提高公众对这些濒危物种的关注。
环境教育：通过展览和活动，教育公众了解海洋生态环境的重要性，提高公众的环境保护意识。
科技支持：运用科技手段，如水下情景学堂，让观众通过互动了解海洋生物和潜水知识，同时利用科技手段保护海洋生物。
绿色品牌：水族馆创建了“My Green，我的绿色”专属绿色品牌，将绿色理念体现在生物展示、市场活动、科普课程以及公益和关爱活动中。
国际交流：水族馆曾击败国际上其他对手，获得2008年国际水族馆大会的主办权，这有助于提高中国在水族馆领域的国际地位，同时促进了国际间的交流与合作。
参与全国科普日活动：水族馆响应全国科普日的号召，举办以科技助力保护海洋生物多样性为主题的科普系列活动，如红树林展缸上演射水鱼的生物绝技，水下情景学堂等。
关注濒危物种：水族馆特别关注濒临绝种的稀有水生生物，如特设的中国展区，展示长江流域水生物、生态及中国已濒临绝种的稀有水生物。
通过这些措施，上海东方明珠塔水族馆不仅为游客提供了一个观赏海洋生物的平台，同时也致力于海洋生物的保护和公众环保意识的提升。