根据提供的参考信息，32名旅客在九寨沟旅游期间可能遇到了以下挑战：
乘车秩序混乱：游客在乘车时可能面临秩序混乱的情况，尤其是在乘车站点，由于没有工作人员维护秩序，导致老年人等游客需要抢座位，甚至出现争吵和差点踩踏的事件。
出租车宰客现象：出租车不打表，宰客现象可能存在，比如从景区到千古情的位置，距离6公里，淡季要价30元，旺季直接翻倍。
网红景点无站点：如芦苇海这样的热门景点没有专门的乘车站点，游客需要步行3公里，途中没有厕所，给游客带来不便。
门票和物价高昂：九寨沟的门票价格较高，淡季门票为80元，旺季为169元，观光车费用为90元。景区内的物价也相对较高，一碗抄手可能要30多元。
高原反应：九寨沟景区海拔较高，最高可达4500米，对于长期生活在平原地区的游客来说，可能会出现头痛、呼吸困难、乏力等高原反应症状，影响旅游体验。
景区管理问题：游客可能对景区的管理存在不满，包括乘车秩序、出租车宰客、物价过高等问题。
交通拥堵：在旅游高峰期，如暑期，九寨沟可能面临人流、车流高峰，给道路交通管理工作带来挑战，可能导致交通拥堵。
旅游节奏和规划：游客可能需要调整旅游节奏，合理安排游览计划，以适应九寨沟景区的高海拔环境和较长的游览路线。
针对上述挑战，九寨沟风景名胜区管理局与九寨沟县交通运输服务中心等相关部门已经采取或提出了相应的整改措施，如强化乘车秩序管理、整治出租行业营运乱象、适时调配摆渡车服务等，以提升游客的旅游体验。