根据提供的参考信息，关于39座旅游大巴在九寨沟的安全性，以下是一些分析：
车辆标准：参考信息[2]和[3]中提到的39座旅游大巴，是用于九寨沟景区直通车巴士自助3日游的交通工具。这些车辆按照旅游行业标准配备，通常符合国家对于旅游车辆的安全要求。
安全措施：在九寨沟旅游大巴上，通常会配备必要的行车安全设备，如车载WIFI、限速标志等。此外，车辆在出发前会进行常规的检查和维护，以确保车辆在行驶过程中的安全。
道路状况：根据参考信息[1]，九寨沟地区的道路交通安全形势曾因道路损毁和重点工程建设施工而异常严峻。因此，相关部门对特定车型实施了道路交通管制措施，包括限制大型旅游大巴通行。
事故记录：参考信息[4]提到，在2019年8月8日九寨沟发生的7.0级地震中，尽管有39名游客通过旅行社前往九寨沟，但所有人都安全无恙。这表明在正常情况下，39座旅游大巴在九寨沟的运行是安全的。
综上所述，39座旅游大巴在九寨沟的运行，通常情况下是安全的。然而，游客在乘坐时仍需注意以下几点：
- 确认车辆符合旅游行业标准，并具备必要的安全设施。
- 注意遵守当地的道路交通规则和管制措施。
- 在地震等自然灾害发生时，保持冷静，遵循相关部门的指导和安排。