九寨沟旅游区不仅以其壮丽的高山湖泊、瀑布群和钙华滩流等自然景观著称，同时也是一处蕴含丰富历史文化遗迹的区域。以下是九寨沟旅游区内的一些历史文化遗迹：
九寨沟藏族村寨：九寨沟内有多个藏族村寨，如树正寨、荷叶寨、则查洼等，这些村寨不仅承载着藏族人民的传统生活方式，也反映了其独特的文化习俗。
藏传佛教遗迹：在九寨沟地区，藏传佛教文化有着深远的影响。一些寺庙、嘛呢石堆（祈祷石）、经幡等宗教遗迹，如日则沟的观音桥，都是重要的文化遗址。
古生物化石：九寨沟地区的地质结构复杂，蕴藏着丰富的古生物化石，这些化石对于研究古生物、古地理和古气候具有重要意义。
历史建筑：如藏碉楼、古磨房、栈桥等，这些历史建筑不仅是九寨沟人文景观的一部分，也反映了当地的建筑技艺和历史变迁。
非物质文化遗产：如藏族的锅庄舞、羌族的推杆、川剧等，这些都是九寨沟地区的非物质文化遗产，反映了当地民族文化的独特性和传承性。
文化传说和神话故事：九寨沟地区流传着许多关于自然景观的传说和神话故事，如诺日朗瀑布的传说，这些故事丰富了当地的文化内涵。
考古遗址：比如芒城遗址，位于青城山附近，有着悠久的历史，是研究古蜀文明的重要遗址。
需要注意的是，九寨沟作为世界自然遗产地，其历史文化的保护同样受到高度重视，这些遗迹是九寨沟旅游资源的重要组成部分，也是游客了解当地文化和历史的重要窗口。