九寨沟旅游区的配套设施建设面临着多方面的挑战，以下是一些主要的问题和挑战：
灾后重建：2017年九寨沟地震给景区造成了严重的破坏，配套设施的重建和修复任务艰巨。需要投入大量人力、物力和财力来恢复原有的旅游服务设施。
环境保护：九寨沟景区拥有丰富的自然景观和生物多样性，建设过程中需要严格遵循生态保护原则，防止对自然环境造成新的破坏。
基础设施建设：景区的道路、供水、供电、通信等基础设施需要全面提升，以满足游客数量增加后的需求。这些基础设施的建设和运营成本较高。
服务质量提升：提高景区的服务质量是吸引游客的关键。包括餐饮、住宿、交通、游览设施等在内的服务质量提升需要大量的资金投入和精细化管理。
管理协调：景区配套设施建设涉及多个部门和管理层面，如规划、建设、环保、交通、旅游等，需要有效的协调机制来确保项目的顺利实施。
游客容量控制：如何合理控制游客数量，防止过度开发对景区造成压力，是一个挑战。需要科学评估游客容量，制定合理的游客管理政策。
公共设施配套：如厕所、停车场、游客服务中心等公共设施的建设和优化，以满足游客的基本需求。
文化传承：在配套设施建设中，如何保留和传承当地文化特色，使旅游产品与文化相结合，也是一大挑战。
资金筹集：旅游区配套设施建设需要大量资金投入，如何有效筹集资金，保障建设项目的资金需求，是一个难题。
可持续发展：在追求经济效益的同时，如何确保旅游业的可持续发展，保护景区的生态环境和文化特色，实现社会、经济和环境的和谐共生。
综合以上挑战，九寨沟旅游区配套设施建设需要在保护自然环境和文化遗产的前提下，通过科学规划、技术创新和精细管理，实现旅游业的可持续发展和经济效益的提升。