九寨沟旅游大巴直通车在行驶过程中，通常会在几个关键的地点设置休息站，以便游客在长时间的旅行中能够适当休息和补给。以下是一些可能的休息站位置：
成都出发站：大多数直通车在出发前会在成都市区内指定地点集合，如茶店子客运站、成都东站客运站等，这些地方本身可能设有休息区。
都江堰休息站：位于成温立交桥附近，这里可以观赏都江堰水利工程，游客可以选择在此休息。
映秀休息站：映秀镇位于都江堰市与汶川之间，这里游客可以稍作休息，了解当地的自然风光。
叠溪海子休息站：这里可以观赏叠溪海子的自然美景。
牟尼沟休息站：牟尼沟景区附近，游客可以在此欣赏牟尼沟的自然风光，并补充能量。
九寨沟口休息站：到达九寨沟口后，游客可以选择在此休息，准备入住酒店或开始景区游览。
需要注意的是，具体的休息站设置可能会有所变动，这取决于旅游大巴的运营公司、当天的行程安排以及路况等因素。通常，旅游大巴直通车会在出发前提供详细的行程安排，包括休息站的具体位置和休息时间。建议在乘坐前，提前与旅游公司确认具体行程和休息站点，以便更好地规划旅行。此外，由于九寨沟地处高原，天气变化多端，游客在休息时应注意保暖和防风。