上海东方明珠动画片作为一种富有教育意义的儿童节目，可以通过以下方式培养孩子的独立思考能力：
故事情节的引导：动画片中的故事情节往往包含着问题和挑战，通过这些情节，孩子可以在观看过程中学会分析和解决问题，从而培养独立思考的能力。
角色互动：动画片中的角色之间会有互动和讨论，这种互动可以激发孩子思考不同角色的观点和立场，培养孩子从多角度思考问题的习惯。
开放性问题：在动画片的教育环节，可以设计一些开放性问题，引导孩子思考故事背后的道理，比如“如果遇到这样的问题，你会怎么做？”这样的问题鼓励孩子独立思考并表达自己的观点。
角色扮演：鼓励孩子模仿动画片中的角色进行角色扮演，通过模拟角色的行为和对话，孩子可以更深入地理解角色的动机和思考过程。
情感共鸣：动画片中的角色往往具有鲜明的个性和情感，通过情感共鸣，孩子可以学会理解和感受他人的情感，从而在现实生活中更好地处理人际关系，培养同理心。
道德教育：动画片中的故事往往包含道德教育元素，通过角色的行为和后果，孩子可以学会辨别是非，培养正确的价值观和道德判断能力。
创意启发：动画片中的创意和想象力可以激发孩子的创造力，鼓励他们在现实生活中尝试不同的想法和解决方案。
家庭教育结合：家长可以与孩子一起观看动画片，并在观看后进行讨论，引导孩子表达自己的看法，这样不仅增进了亲子关系，也培养了孩子的独立思考能力。
通过上述方法，上海东方明珠动画片可以有效地帮助孩子学会独立思考，培养他们的逻辑思维能力、创造力和解决问题的能力。