在上海东方明珠地铁站办理交通联合卡，您可以按照以下步骤进行：
前往服务台：到达东方明珠地铁站后，找到地铁站内的服务台。服务台通常位于地铁站正中央或者显眼位置。
咨询与申请：向服务台的营业员咨询关于交通联合卡的办理流程。您需要提供有效的身份证件，如身份证、护照等。
填写申请：按照营业员的指导，填写交通联合卡的申请表格。表格上需要填写您的个人信息，包括姓名、身份证号码等。
缴纳押金：办理交通联合卡需要缴纳一定的押金，通常是20元人民币。您可以选择现金或使用银行卡支付。
领取卡片：缴纳押金并填写完表格后，工作人员会为您制作交通联合卡。在卡片制作完成后，您将获得一张新的交通联合卡。
充值使用：如果您需要立即使用交通联合卡，可以在地铁站内的自助充值机或服务台进行充值。充值后，您就可以使用这张卡在上海的公共交通系统中进行支付了。
需要注意的是，根据《上海市关于公共交通卡互联互通的通知》，带有“交通联合”标志的公共交通卡在上海地铁是可以使用的。但根据您提供的参考信息，目前这些卡在上海只能在本市进行充值，尚不能进行异地充值。异地发行的带有“交通联合”标志的公共交通卡在上海暂不能办理充值且不享受公共交通换乘优惠。
此外，根据您提供的参考信息，上海地铁的所有站点都可以办理公交卡，所以东方明珠地铁站也具备办理交通联合卡的条件。如果您需要更详细的信息或有其他疑问，建议直接向地铁站内的服务台咨询。