上海东方明珠广播电视塔在建设过程中遇到了多项施工难点，以下是一些主要的挑战：
高度挑战：东方明珠塔高达468米，在当时是亚洲第一高楼，世界第三高楼。这样的高度对于施工技术和材料的要求都非常高。
多筒结构施工：东方明珠塔采用了多筒结构设计，包括三根直径9米、高287米的空心擎天大柱，以及斜柱和球体的组合。这种复杂结构的设计和施工都需要精确的技术和工艺。
斜筒体施工：在东方明珠塔的建设中，3根斜筒体的施工是关键。叶可明院士提出的分节脱模斜振动工艺攻克了这一难题，确保了斜筒体的成功施工。
抗风性能：考虑到上海地区多风，东方明珠塔的设计需要充分考虑抗风性能。塔身的设计抗震标准为“7级不动，8级不裂，9级不倒”，并且具有良好的抗风性能。
钢天线桅杆提升：东方明珠塔的450吨重钢天线桅杆提升施工是一项重大挑战。在天线提升过程中，遇到超过起重施工极限的8级以上大风，这要求施工团队有极高的风险控制能力。
施工工艺创新：在东方明珠塔的建设中，许多施工工艺都是创新性的，如计算机同步控制技术和液压提升工艺等，这些技术在当时处于国际先进水平。
安全隐患处理：在建设过程中，可能遇到的安全隐患也需要及时处理，确保施工安全和工程质量。
综上所述，东方明珠塔的建设过程中，施工团队克服了高度挑战、复杂结构设计、抗风性能要求、技术创新以及安全隐患处理等多方面的难题。