上海东方明珠塔遭遇雷击的原因可以从以下几个方面进行分析：
地理位置和建筑高度：东方明珠塔作为一座高467.9米的标志性建筑，位于黄浦江畔，这样的地理位置和高度使其更容易成为雷电的攻击目标。因为高层建筑更容易被雷电击中，尤其是当雷云接近地面时，高大的建筑物由于其尖锐的顶端，更容易吸引雷电。
雷击原理：雷击通常发生在云层与地面之间，或者云层与云层之间。当雷云中的电荷积累到一定程度时，会形成强大的电场，导致空气击穿，产生闪电。高层建筑由于其高度，更容易成为这种电场中的“尖端”，从而吸引雷电。
雷击部位：根据报道，东方明珠塔的雷击发生在顶端发射天线。专家指出，这次雷击打在了天线外面的玻璃钢罩上，击穿后点燃了保温层的非阻燃石棉。这说明雷击点位于天线外罩，而非塔身。
避雷措施：东方明珠塔曾装备了半导体少长针消雷器，这种产品曾在上世纪90年代引起了学术界的辩论。尽管如此，从事件中可以看出，该设备可能未能有效防止雷击。现代高层建筑通常会安装避雷针系统，以将雷电安全地引导至地面。
雷电活动：在雷击事件发生前，上海市气象台发布了雷电黄色预警，说明当时当地存在较强的雷电活动，这为雷击事件的发生提供了条件。
综上所述，上海东方明珠塔遭遇雷击的原因是多方面的，包括其地理位置、高度、雷击原理、雷击部位、避雷措施以及当时当地的雷电活动等。这也提醒我们在设计、建设和维护高层建筑时，需要充分考虑雷电防护措施，以确保建筑物的安全。