在南京短租夫子庙进行三日游，以下是一些建议的景点和行程安排：
第一天：历史与文化之旅
- 夫子庙：作为南京的文化象征，夫子庙周边有许多历史建筑，如白鹭洲书院、乌衣巷等，可以感受古都的文化氛围。
- 秦淮河：乘坐游船游览秦淮河，欣赏两岸的古建筑和夜景，体验“十里秦淮”的韵味。
- 南京博物院：了解南京乃至中国的历史文化，特别是南京的六朝文化。
- 总统府：参观总统府，了解民国时期的历史。
第二天：自然与人文之旅
- 紫金山：游览紫金山，参观中山陵、明孝陵等历史名胜，同时欣赏山间美景。
- 紫金山国家森林公园：在森林中漫步，感受大自然的宁静与美丽。
- 梅花山：如果是春季，梅花盛开，可以欣赏到美丽的梅花景色。
第三天：美食与购物之旅
- 美食街：品尝南京特色美食，如鸭血粉丝汤、盐水鸭、锅盖面等。
- 河西大市场：购买纪念品、特产，体验南京的市井生活。
- 夫子庙周边：逛逛夫子庙周边的小店，购买手工艺品和特色商品。
住宿建议：
由于您选择短租，建议选择夫子庙附近的酒店或青年旅社，方便出行和体验当地文化。
交通建议：
南京地铁非常发达，建议购买一张地铁卡，方便出行。同时，也可以考虑租一辆自行车，在紫金山等景点游览时更加自由。
希望这些建议能够帮助您在南京度过一个愉快的假期！