在南京夫子庙进行三天游时，以下是一些您可以免费参观的景点：
夫子庙：作为南京的标志性景点，夫子庙本身是免费的。在这里，您可以欣赏到古老的建筑群，包括大成殿、文庙、乌衣巷、桃叶渡等。
秦淮河风光带：沿着秦淮河畔散步，可以欣赏到美丽的夜景，体验南京的历史风情。虽然乘船游览需要付费，但河畔本身是免费的。
夫子庙步行街：夫子庙周边的步行街不收费，您可以在这里品尝南京小吃、购买纪念品。
白鹭洲公园：位于夫子庙附近的白鹭洲公园是免费的，您可以在这里散步、拍照。
老门东：老门东历史文化街区不收门票，您可以在这里感受老南京的文化氛围，品尝当地美食。
南京城墙：部分南京城墙区域是开放的，您可以免费漫步在古城墙上，俯瞰夫子庙和秦淮河的美景。
鸡鸣寺：虽然鸡鸣寺本身需要购票，但寺外的区域和部分建筑是免费的，您可以在寺外欣赏其古朴的建筑风格。
玄武湖公园：玄武湖公园是免费的，您可以在这里散步、划船、欣赏湖光山色。
需要注意的是，部分景点内部或特定的参观区域可能需要购票，建议在游玩前查询具体的开放情况和收费标准。