三天九寨沟的旅游住宿选择，主要应考虑以下因素：
景区内住宿：
- 优点：节省时间，减少往返景区的交通成本，可以更充裕的时间游览景区。
- 缺点：可能价格较高，且选择相对有限。
- 推荐：如果预算允许，建议选择景区内的住宿，如度假酒店、客栈等，这样可以更好地体验景区内的夜晚和清晨。
景区外住宿：
- 优点：价格相对较低，选择较多，设施可能更齐全。
- 缺点：需要额外花费时间往返景区，可能因为交通不便而影响游览体验。
- 推荐：如果预算有限，可以选择景区外的住宿，尤其是在黄龙九寨沟站附近，便于第二天前往九寨沟。
具体选择：
- 第一天：可以选择在成都市区住宿，以方便抵达和休息。
- 第二天：如果选择景区外住宿，建议选择黄龙九寨沟站附近的酒店，以便第二天前往九寨沟。如果选择景区内住宿，则可以提前预订九寨沟景区内的酒店。
- 第三天：根据第二天的游览情况，可以选择在九寨沟景区内住宿，以便更充分地游览，或者在景区外住宿，便于第四天的返程。
其他注意事项：
- 季节性因素：九寨沟地区气候多变，冬季可能需要考虑保暖，夏季则需注意防晒。
- 预订时间：建议提前预订住宿，尤其是在旅游旺季，以免出现房源紧张的情况。
- 交通方式：选择住宿时，应考虑交通方式是否便利，是否有直达景区的交通工具。
综上所述，根据您的预算、时间安排和旅游偏好，合理选择景区内或景区外住宿，以确保您的三天九寨沟之旅既舒适又愉快。