九寨沟全域恢复旅游在保护生态环境方面采取了以下措施：
生态修复与升级改造：自2017年地震后，九寨沟景区进行了全面的生态修复与升级改造。包括补植、补造树木27万株，累计修复、恢复生态环境达到2585亩。这些措施有助于恢复受损的生态系统，提高景区的生物多样性。
地质灾害治理：对170处地质灾害进行了治理，确保了景区内游客和生态环境的安全。通过治理，减少了山体滑坡、泥石流等自然灾害的发生，保护了景区的生态环境。
全天候监测与管控：对灾害点进行全天候监测和全方位管控，确保及时掌握景区内的生态环境变化，对可能出现的生态问题进行快速响应和处理。
保护区的设立：新建了长海、树正等5个自然保护区保护站，常态化开展动植物、水质、空气等监测，确保景区内生态环境的稳定。
环境友好原则：在灾后重建过程中，坚持环境友好、影响最小原则，探索灾后世界自然遗产地质、水文、景观、生态等修复保护新技术和方法。
生态旅游发展：从景点旅游向全域旅游转变，从传统观光游向综合立体游转变。通过开发新的旅游线路和景点，减少对传统景点的过度依赖，降低对生态环境的压力。
游客教育与管理：加强对游客的生态教育，提高游客的环保意识。同时，对游客的不文明行为进行管理，如禁止乱扔垃圾、禁止在景区内野餐等，以减少对生态环境的破坏。
可持续发展战略：坚持可持续发展的思想战略方法，确保景区的生态环境在旅游发展的同时得到有效保护。
通过以上措施，九寨沟全域恢复旅游在保护生态环境方面取得了显著成效，为游客提供了一个美丽、安全的旅游环境。