上海东方明珠塔别墅的户型布局从风水学角度来分析，可以有以下几点看法：
户型结构：根据提供的信息，该别墅为地上三层，拥有多个房间和功能区域，包括客厅、餐厅、卧室、书房、车库等。这种布局符合现代住宅的居住需求，动静分离，各功能区域相对独立，有利于居住者的日常生活。
塔型建筑：风水学中提到，塔型建筑适合商业用途，不适合居住。东方明珠塔作为上海的地标性建筑，虽然其本身为商业用途，但作为别墅而言，塔型设计可能会被认为不利于居住者的精神状态。然而，别墅的具体设计可能已经考虑了这一点，通过适当的调整和优化，以适应居住需求。
外型上宽下窄的建筑：如果别墅的外观设计为上宽下窄，则可能会给人头重脚轻的观感，这在风水学中是不利的。但从提供的信息中并未描述别墅的具体外观设计，因此无法直接判断。
入户花园和周边环境：别墅拥有环绕式花园和南进门的设计，这有助于聚集正能量，有利于居住者的运势。同时，周边配套设施齐全，包括学校、公园、商业中心等，有利于居住者的生活品质。
房屋结构风水禁忌：风水学中还有一些禁忌，如屋小门大、入门先见厨厕、横梁压顶等。从提供的信息来看，别墅的布局似乎没有违反这些禁忌。
室内布局：别墅的室内布局合理，南北通透，有利于采光和通风。每个房间都有足够的采光和通风，有利于居住者的身心健康。
综上所述，从风水学角度来看，上海东方明珠塔别墅的户型布局在考虑居住舒适性和风水禁忌方面，似乎是比较合理的。然而，风水学是一门复杂的学问，具体的判断还需要结合更多细节和实际情况。在购房时，建议综合考虑自身需求和风水因素，选择最适合自己的住宅。