查询与预订上海东方明珠塔到南京的机票，您可以按照以下步骤操作：
选择机票查询平台：
- 您可以通过各大机票预订网站，如携程、去哪儿、飞猪等，或者航空公司官方网站进行查询和预订。
输入查询信息：
- 在预订平台搜索栏中输入出发地（上海）和目的地（南京），选择出发日期。
筛选与比较：
- 根据您的需求，筛选直飞或转机航班，比较不同航空公司的价格和航班时间。
预订机票：
- 选择合适的航班后，按照网站指示填写旅客信息和支付信息，完成预订。
以下是一些具体的操作步骤：
携程：进入携程官网或APP，点击“机票”选项，输入出发地上海，目的地南京，选择出发日期，搜索后比较不同航班信息，选择后按照提示完成预订。
去哪儿：同样，在去哪儿官网或APP中搜索上海到南京的机票，比较价格和时间，选择后进行预订。
航空公司官网：直接访问上海浦东国际机场或虹桥国际机场对应航空公司的官网，进行查询和预订。
注意事项：
- 提前预订通常能获得更优惠的价格。
- 根据个人需求，选择合适的航空公司和航班类型。
- 考虑行李额度，提前了解托运行李的相关规定。
- 预订成功后，注意保留订单信息，以便后续查询或改签。
请注意，机票价格会根据季节、节假日、政策调整等因素波动，建议您在预订前进行多渠道比较，选择最合适的航班和价格。