从上海东方明珠塔前往南京高铁站的换乘步骤如下：
从东方明珠塔出发：
- 步行260米到达地铁二号线陆家嘴站。
乘坐地铁：
- 在陆家嘴站乘坐上海地铁2号线。
- 坐车经过12站，到达上海火车站。
换乘高铁：
- 在上海火车站，找到前往南京的高铁站台。
- 根据您的时间安排，可以选择合适的车次。例如，从南京南站出发到上海虹桥站的高铁有很多班次，您可以选择最早一班d5661动车组，南京南-上海虹桥，发车时间为06:50，历时1小时40分。
- 在上海虹桥站乘坐前往南京的高铁。
到达南京南站：
- 按照高铁的行程，您将到达南京南站。
请注意以下几点：
- 考虑到旅途的实际情况，请提前规划好您的行程，预留充足的时间。
- 确认好您的高铁车次和时间，避免错过。
- 出发前，最好查看最新的交通信息，以防万一。
- 旅行期间，注意个人物品的安全。
根据您提供的参考信息，您可以选择早上较早的高铁班次，如d5661动车组，以确保您有足够的时间从上海东方明珠塔出发，顺利换乘并到达南京南站。