是的，上海东方明珠塔的建设过程中面临了诸多挑战。
首先，在项目背景中提到，该项目最初在招标时，由于设计难度大，没有任何一家企业愿意承接。这表明了设计本身的复杂性和施工的难度。
具体来说，建设过程中遇到的挑战包括：
施工现场环境特殊：由于工程位于黄浦江岸线附近，施工方案的合理性和可行性受到了极大的考验。
地质状况复杂：施工现场的地质条件可能较为复杂，这增加了施工的难度和风险。
机械设备安装困难：超高层建筑对施工机械的安装提出了更高的要求，可能存在设备难以安装的问题。
技术难题：在设计和施工过程中，需要克服的技术难题包括超高层钢结构的建设、旋转机械设备的详细控制与运作等。
结构设计挑战：例如，"申"字方案中的多个倾斜柱墩设计，虽然在美学上别具一格，但增加了结构受力分析和施工的复杂性。
抗震抗风设计：为了确保建筑的安全性，必须进行严格的抗震和抗风设计，这也是一项技术挑战。
尽管面临这些挑战，但通过施工方的努力和技术的创新，东方明珠广播电视塔最终成功建成，成为中国现代建筑建设的历史遗产，并成为上海的标志性建筑之一。