上海东方明珠塔在抗洪期间加强与政府部门的沟通，可以采取以下措施：
建立应急沟通机制：在抗洪期间，东方明珠塔应立即启动应急响应机制，建立与政府部门的直接沟通渠道，确保信息的及时传递。
明确沟通联系人：指定专人负责与政府部门沟通，确保信息的准确性和时效性。
及时汇报情况：定期向政府部门汇报抗洪进展、面临的困难和需求，以便政府及时了解情况并给予支持。
积极参与政府会议：积极参加政府部门组织的抗洪工作会议，与相关部门共同研究解决方案。
建立信息共享平台：利用互联网、短信等手段，建立抗洪信息共享平台，确保信息的快速传递。
加强合作与协调：与政府部门、救援队伍、周边社区等建立良好的合作关系，共同应对抗洪工作。
宣传正面信息：在抗洪期间，积极宣传正面信息，提高社会对抗洪工作的关注和支持。
关注政策法规：密切关注国家和地方政府的抗洪政策法规，确保东方明珠塔在抗洪工作中的合法合规。
提供技术支持：利用东方明珠塔的技术优势，为政府部门提供抗洪工作中的技术支持。
总结经验教训：在抗洪结束后，及时总结经验教训，为今后类似事件提供借鉴。
通过以上措施，上海东方明珠塔在抗洪期间能够加强与政府部门的沟通，确保抗洪工作的顺利进行。