上海东方明珠塔顶被雷击的原因主要与以下几个因素有关：
高度因素：东方明珠塔高达467.9米，属于超高层建筑。高层建筑由于其高度优势，更容易成为雷电的攻击目标。雷电通常喜欢从高到低传播，因此高层建筑更容易被雷击中。
地理位置：东方明珠塔位于上海浦东陆家嘴，这里是中国乃至亚洲的经济金融中心之一，因此建筑密集，天气变化复杂。当雷暴天气发生时，由于附近有大量的建筑物，雷电活动可能更加频繁。
设计特点：东方明珠塔的设计具有一定的尖锐性，塔顶的发射天线部分更加尖锐，根据物理学原理，尖锐的物体更容易吸引雷电。
气象条件：在雷暴天气中，如果空气中的湿度较高，且温度差异较大，容易形成强烈的上升气流，这些条件都有利于雷电的形成和传播。
防雷设施：虽然高层建筑通常会安装避雷针系统，但即使有完善的避雷系统，也不能保证完全避免雷击。避雷针主要是将雷电流通过导线导入大地，减少雷击对建筑物的破坏，但并不能完全阻止雷击的发生。
综上所述，东方明珠塔被雷击是多种因素共同作用的结果，既有自然条件的影响，也有建筑本身的特性。对于此类高风险环境，建筑物的防雷设计需要更加科学和严格，以确保人员和设备的安全。