上海东方明珠塔作为中国著名的地标性建筑，其结构安全性一直是设计者和维护者关注的重点。根据所提供的信息，以下是对东方明珠塔顶雷击后塔身结构安全性的分析：
避雷针系统：东方明珠塔安装了避雷针系统，这是高层建筑中防止雷击的标准配置。避雷针系统能够将雷电流安全地引导至地面，从而保护建筑本体不受雷击的直接伤害。在雷暴天气中，东方明珠塔顶被雷击的情况确实发生过，但通过避雷针系统的保护，塔身结构并未受到损害。
设计规范：东方明珠塔的设计遵循了《建筑物防雷设计规范》，这确保了塔身结构在雷击等极端天气条件下的安全性。该规范对建筑物的防雷设计提出了严格的要求，包括避雷针的设置、接地系统的设计等。
材料选择：东方明珠塔在建造时，选用了耐腐蚀、强度高的建筑材料，这些材料能够承受雷击产生的巨大能量，减少雷击对建筑结构的影响。
维护保养：东方明珠塔作为重要的城市基础设施，定期进行维护保养，确保其结构安全。在雷击事件后，也会对避雷针系统进行检测和维护，确保其正常工作。
历史经验：东方明珠塔自1994年竣工以来，已经历了多次雷击事件，但塔身结构始终安全。这表明塔的设计和防雷措施是有效的。
综上所述，尽管东方明珠塔在雷暴天气中遭遇雷击，但通过避雷针系统、设计规范、材料选择和维护保养等措施，塔身结构的安全性得到了保障。在遭遇雷击后，东方明珠塔的结构依然稳固，可以继续安全使用。