三天两晚的南京夫子庙旅游住宿安排如下：
第一天：
住宿选择：您可以选择汉庭快捷酒店（南京夫子庙店）、南京状元楼酒店或南京梦乡宾馆等。这些酒店地理位置优越，位于夫子庙景区内，出行方便，可以方便地游览夫子庙周边景点。
行程安排：
- 上午：抵达南京，入住酒店后稍作休息。
- 下午：游览夫子庙、江南贡院、古桃叶渡、文德桥、乌衣巷、李香君故居等景点。
- 晚上：在夫子庙附近品尝南京特色小吃，如鸭血粉丝汤、盐水鸭等，逛夫子庙步行街。
第二天：
住宿选择：可以选择星程酒店（南京夫子庙店）或桔子酒店（南京夫子庙店）等，这些酒店位于夫子庙步行街商业区，方便购物和游玩。
行程安排：
- 上午：游览中山陵、紫金山，或者去南京大屠杀纪念馆、云锦博物馆。
- 下午：乘坐地铁前往中华门站，游览甘熙故居。
- 晚上：逛新街口商圈，购物休闲。
第三天：
住宿选择：如果您对住宿有特殊要求，可以考虑南京颐和芥子园酒店或南京金陵状元楼大酒店等，这些酒店提供更为舒适的住宿体验。
行程安排：
- 上午：游览玄武湖，如果时间允许，可前往情侣园游玩。
- 下午：根据个人兴趣，可以选择游览南京其他景点，如总统府、老门东等。
- 晚上：结束愉快的南京之旅，准备返程。
注意事项：
- 根据个人喜好和预算选择合适的酒店。
- 提前预订酒店，确保住宿无忧。
- 注意交通，合理规划行程，避免行程过于紧凑。
- 携带好个人证件和行李，确保旅行安全。