九寨沟客运运业在发展过程中面临以下挑战：
旅游高峰期游客人数过多：随着九寨沟景区的知名度和游客量的增加，尤其是在旅游高峰期，游客数量超出景区承载量，容易导致游客滞留，给客运运业带来压力。
交通拥堵：由于游客数量增加，自驾游、自助游的游客增多，导致交通压力增大，容易引发交通拥堵，影响客运运业的正常运营。
服务质量要求提高：随着旅游市场的竞争加剧，游客对旅游服务的质量要求不断提高，客运运业需要提供更加优质、便捷的服务。
交通基础设施不足：虽然九寨沟县不断完善客运站场服务布局，但仍然存在基础设施不足的问题，如道路狭窄、交通接驳设施不完善等。
环保要求严格：九寨沟景区地处自然保护区，对客运运业提出了更高的环保要求，如何在保障游客运输需求的同时，减少对环境的污染，成为客运运业面临的一大挑战。
安全管理与培训：客运运业需要加强安全管理，确保游客的人身安全。同时，对驾驶员和服务人员进行专业培训，提高服务质量和应对突发事件的能力。
区域协作与协调：九寨沟县需要与周边地区加强协作，共同解决跨区域旅游运输问题，提高整体旅游运输效率。
应对突发事件的能力：面对自然灾害、突发事件等不可预测因素，客运运业需要提高应对能力，确保游客的安全和利益。
市场变化与适应：随着旅游市场的发展，客运运业需要不断适应市场变化，调整经营策略，以满足游客的多样化需求。
政策法规变化：国家旅游政策和法规的变化，如新旅游法的实施，对客运运业提出了新的要求，需要及时调整经营模式以适应政策变化。