在九寨沟旅游中遇到包车服务被查的情况，游客可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
保留证据：在遇到问题或纠纷时，首先应当保留好相关证据，如合同、发票、短信记录、录音、录像等，这些都可能成为后续维权的有力依据。
与旅行社沟通：首先与旅游包车服务的旅行社进行沟通，了解情况，表达自己的诉求。如果旅行社能够及时解决问题，那么可以避免进一步的法律程序。
投诉当地旅游管理部门：如果旅行社不能提供满意的解决方案，游客可以向当地旅游管理部门投诉。例如，可以向九寨沟县文化旅游局或者阿坝州文化旅游局投诉，反映遇到的问题。
联系消费者协会：游客还可以联系当地消费者协会，寻求帮助。消费者协会会根据相关法律法规，协助游客维护自己的合法权益。
法律途径：如果上述途径都无法解决问题，游客可以考虑通过法律途径维权。可以咨询律师，了解自己的权利和义务，根据律师的建议采取相应的法律行动，如提起民事诉讼等。
以下是具体的维权步骤：
收集证据：收集与旅游包车服务相关的所有证据，包括合同、行程安排、付款凭证、通讯记录等。
投诉：向旅行社提出正式投诉，要求说明情况并解决问题。如果旅行社不予理睬，可以向旅游管理部门投诉。
调解：如果问题无法通过旅行社解决，可以请求旅游管理部门进行调解。
仲裁或诉讼：如果调解无效，可以向仲裁机构申请仲裁或者直接向人民法院提起诉讼。
媒体报道：如果上述措施均无法解决问题，可以考虑通过媒体曝光，引起社会关注，增加维权的力度。
在整个维权过程中，游客要保持冷静，依法行事，不要采取过激行为，以免影响维权效果。同时，也要注意保护自己的个人信息，避免个人信息泄露。