在上海东方明珠二居室的购房贷款中，违约金的调整通常遵循以下原则：
合同约定优先原则：首先，根据《中华人民共和国民法典》的规定，合同当事人应当遵循诚实信用原则，根据合同约定履行各自的义务。如果购房合同中对于违约金有明确的约定，则应当按照约定执行。
合理原则：违约金的数额应当与违约行为造成的损失大致相当，如果约定的违约金过高或者过低，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以调整。
以下是一些具体的调整情况：
原案例中提及的违约金比例：根据您提供的参考信息[1]，合同中明确约定的违约金可能高达房价的20%。这种比例通常在当事人没有恶意违约的情况下，如果合同中已有约定，法院通常会尊重当事人的约定。
《三价就低》政策影响：根据参考信息[2]，由于“三价就低”房贷新政，可能导致购房人因贷款额度降低而违约。在这种情况下，合同中可以加入因贷款受限导致无法继续履约，双方可以和平解约而无需承担违约金的补充条款。
逾期风险补偿金：参考信息[3]中提到的逾期风险补偿金政策调整，对违约金数额有明确的限制，以避免过高的违约金给借款人造成不必要的经济负担。
利率调整：参考信息[5]和[6]提到，上海地区的房贷利率会有所调整，如遇国家金融政策调控，借款利率可能发生变化，这也会影响违约金的计算。
民间借贷利率规定：根据参考信息[6]，如果约定的违约金高于银行同类贷款利率4倍，法院可以参照银行同类贷款利率4倍进行调整。
总结来说，上海东方明珠二居室购房贷款违约金的调整应综合考虑以下因素：
- 购房合同中的具体约定；
- 违约行为给对方造成的实际损失；
- 当地及国家的相关法律法规；
- 国家金融政策调整等。
如有具体案例，建议咨询专业律师，以获得更准确的解答。